شرکت زرافشان در سال 1382 توسط تنی چند از دانش آموختگان و اساتید بخش کشاورزی با هدف تولید اختصاصی کودهای شیمیایی کلاته پایه گذاری شد که پس از طی مراحل اجرایی موفق به اخذ پروانه بهره برداری از وزارت صنایع و معادن، موسسه تحقیقات خاک وآب وزارت جهاد کشاورزی در زمینه تولید انواع کودهای شیمیایی، پروانه وزارت بهداشت، درمان و آموزش پزشکی در خصوص حشره کش‌های خانگی و پروانه فرمولاسیون سموم دفع آفات نباتی از سازمان حفظ نباتات گردیده است.